LC-MS/MS修飾位點(diǎn)鑒定
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發(fā)布時(shí)間:2024-05-21 08:15:32 更新時(shí)間:2025-02-18 14:35:05
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LC-MS/MS修飾位點(diǎn)鑒定是使用液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)(LC-MS/MS)來(lái)確定蛋白質(zhì)或肽段上的特定化學(xué)修飾位置的方法。這包括磷酸化、糖基化、泛素化等多種生物學(xué)上重要的修飾。這種技術(shù)對(duì)于了解蛋白質(zhì)功能、蛋白質(zhì)相互作用、信號(hào)傳導(dǎo)路徑以及疾病相關(guān)蛋白質(zhì)的變化尤為重要。
修飾位點(diǎn)鑒定的基本步驟包括:
樣品準(zhǔn)備:蛋白質(zhì)或肽段樣品經(jīng)過(guò)提取和純化,可能還包括特定修飾富集的步驟,以增加檢測(cè)到特定修飾的可能性。
液相色譜分離:通過(guò)液相色譜將樣品中的肽段進(jìn)行分離,以減少樣品復(fù)雜度并提高后續(xù)質(zhì)譜分析的準(zhǔn)確性。
質(zhì)譜分析:肽段在質(zhì)譜儀中被電離并測(cè)量其質(zhì)荷比(m/z)。特定肽段被選擇進(jìn)行進(jìn)一步的碎裂(MS/MS),產(chǎn)生一系列的碎片離子,這有助于識(shí)別修飾的準(zhǔn)確位置。
數(shù)據(jù)分析:使用特定的軟件分析MS/MS數(shù)據(jù),對(duì)碎片離子進(jìn)行識(shí)別和序列分配,從而確定肽段上的修飾位置。軟件分析通常依賴(lài)于數(shù)據(jù)庫(kù)搜索或譜圖匹配。
通過(guò)LC-MS/MS鑒定修飾位點(diǎn),研究人員可以獲得有關(guān)蛋白質(zhì)如何在不同生物學(xué)條件下被修飾的詳細(xì)信息,這對(duì)于理解細(xì)胞內(nèi)信號(hào)傳遞、蛋白質(zhì)功能及其在疾病中的角色至關(guān)重要。
通過(guò)液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)(LC-MS/MS)結(jié)合數(shù)據(jù)庫(kù)檢索進(jìn)行蛋白質(zhì)修飾位點(diǎn)的鑒定,實(shí)際上是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中的一項(xiàng)強(qiáng)大技術(shù)。它不僅可以鑒定蛋白質(zhì)序列和表達(dá)量,還能檢測(cè)和定量蛋白質(zhì)上的各種化學(xué)修飾,如磷酸化、乙?;?、甲基化、泛素化、琥珀?;取4送?,一些特殊的小分子藥物修飾也可以通過(guò)這種方法被鑒定。這對(duì)于深入理解蛋白質(zhì)功能、調(diào)控機(jī)制及其在疾病中的作用至關(guān)重要。
為了提高特定蛋白質(zhì)修飾位點(diǎn)檢測(cè)的準(zhǔn)確性和靈敏度,樣品前處理過(guò)程中的蛋白質(zhì)或肽段的純化與富集是非常重要的步驟。這可以通過(guò)多種方法實(shí)現(xiàn),包括:
免疫沉淀(IP):使用針對(duì)目的蛋白或特定修飾的抗體進(jìn)行富集。
親和純化:利用蛋白質(zhì)或其修飾與某些固定相之間的特異性親和作用進(jìn)行純化。
SDS-PAGE:通過(guò)電泳分離基于大小的蛋白質(zhì),然后進(jìn)行切割和進(jìn)一步分析。
結(jié)合這些富集和純化技術(shù),可以顯著提高目標(biāo)蛋白修飾位點(diǎn)檢測(cè)的選擇性和靈敏度。通過(guò)LC-MS/MS分析和數(shù)據(jù)庫(kù)檢索,可以準(zhǔn)確鑒定蛋白質(zhì)序列中的特定修飾位點(diǎn),包括上述提到的多種化學(xué)修飾類(lèi)型。這種方法的強(qiáng)大之處在于它的多功能性和高通量能力,能夠在單一實(shí)驗(yàn)中檢測(cè)多達(dá)8種甚至更多已知的蛋白質(zhì)修飾類(lèi)型。
綜上所述,LC-MS/MS結(jié)合先進(jìn)的樣品處理技術(shù),為蛋白質(zhì)修飾位點(diǎn)的高效鑒定提供了強(qiáng)大的工具,這對(duì)于推進(jìn)生物學(xué)研究和藥物開(kāi)發(fā)具有重要意義。
證書(shū)編號(hào):241520345370
證書(shū)編號(hào):CNAS L22006
證書(shū)編號(hào):ISO9001-2024001
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